Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA3O43365 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA3O43365 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA3O43365 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA3O43365 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA3O43365 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA3O43365 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA3O43365 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA3O43365 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms