Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2AO14813 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms