Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASTN1O14525 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASTN1O14525 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms