Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE2AO00408 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE2AO00408 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms