Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF10AO00220 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF10AO00220 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms