Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3BRM9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3BRM9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3BRM9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H3BRM9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BRM9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms