Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
E9PCH4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
E9PCH4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
E9PCH4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
E9PCH4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
E9PCH4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
E9PCH4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
E9PCH4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
E9PCH4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
E9PCH4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
E9PCH4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
E9PCH4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
E9PCH4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
E9PCH4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
E9PCH4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
E9PCH4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
E9PCH4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
E9PCH4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
E9PCH4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
E9PCH4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
E9PCH4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
E9PCH4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
E9PCH4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
E9PCH4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
E9PCH4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
E9PCH4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms