Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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