Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms