Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO5BA8MYB1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCO5BA8MYB1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms