Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOBPA7XYQ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOBPA7XYQ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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