Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL13PA6NNM8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLL13PA6NNM8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms