Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC10BA6NIK2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC10BA6NIK2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC10BA6NIK2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms