Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CFAP73A6NFT4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CFAP73A6NFT4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms