Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6L3A6NEY3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6L3A6NEY3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms