Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM43BA6NCK2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM43BA6NCK2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms