Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRGMA1A4Y4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms