Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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TCRBV7S3A2A0A539 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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TCRBV7S3A2A0A539 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TCRBV7S3A2A0A539 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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TCRBV7S3A2A0A539 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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TCRBV7S3A2A0A539 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TCRBV7S3A2A0A539 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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TCRBV7S3A2A0A539 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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TCRBV7S3A2A0A539 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV7S3A2A0A539 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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