Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0U1RQJ8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms