Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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