Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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