Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-219ENST00000484469 558 ntTSL 319.43■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-220ENST00000487958 796 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-209ENST00000448139 601 ntTSL 515.7■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 AP2M1-210ENST00000455925 545 ntTSL 415.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 MPZL1-207ENST00000465787 1305 ntTSL 1 (best)26.14■■□□□ 1.779e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 MPZL1-205ENST00000448405 1596 ntTSL 1 (best)25.13■■□□□ 1.619e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.249e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 CDC73-202ENST00000477868 764 ntTSL 312.45□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.295e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 RAB27A-208ENST00000566877 663 ntTSL 35.75□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-221ENST00000560451 5124 ntTSL 1 (best)23.14■■□□□ 1.39e-7■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 49.83□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 45.3
UTP3Q9NQZ2 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 218.86■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 318.83■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 EMD-207ENST00000486738 1284 ntTSL 318.72■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 EMD-206ENST00000485261 792 ntTSL 318.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ITGA5-213ENST00000553071 1013 ntTSL 1 (best)18.37■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 EMD-204ENST00000468294 501 ntTSL 215.9■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ITGA5-202ENST00000435631 1240 ntTSL 215.84■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 WDR45B-202ENST00000571767 789 ntTSL 213.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 FKBP8-214ENST00000609656 220 ntTSL 26.96□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-9■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.384e-9■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRD1-205ENST00000463141 571 ntTSL 211.63□□□□□ -0.554e-9■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRD1-206ENST00000471008 3672 ntTSL 1 (best)11.61□□□□□ -0.554e-9■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ARPC1B-217ENST00000481997 945 ntTSL 216.08■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.688e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-244ENST00000637202 1634 ntTSL 518.12■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-205ENST00000518087 918 ntTSL 517.66■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-234ENST00000636715 1025 ntTSL 512.27□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-259ENST00000637792 581 ntTSL 49.36□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-229ENST00000636537 1056 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 ASAH1-260ENST00000637805 780 ntTSL 57.56□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 MACF1-216ENST00000476350 5304 ntTSL 29.65□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 MACF1-229ENST00000530262 6257 ntTSL 58.6□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-203ENST00000524972 696 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-207ENST00000529403 1697 ntTSL 29.96□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-206ENST00000528110 829 ntTSL 29.49□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-208ENST00000530114 663 ntTSL 38.49□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-204ENST00000525035 703 ntTSL 37.36□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-209ENST00000533602 560 ntTSL 37.15□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-205ENST00000528042 763 ntTSL 26.95□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 07e-8■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 TNNT1-206ENST00000586649 340 ntTSL 58.98□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 45.2
UTP3Q9NQZ2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 45.1
UTP3Q9NQZ2 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 45.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 45.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 217.27■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 45.1
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 45.1
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-209ENST00000483553 1307 ntTSL 517.11■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 45.1
UTP3Q9NQZ2 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 516.53■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 514.48□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ID3-203ENST00000486541 892 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-204ENST00000376138 3503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-201ENST00000346832 3289 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-205ENST00000376139 3516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.078e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.178e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.498e-7■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.482e-6■■■■■ 45
UTP3Q9NQZ2 PRRC2A-213ENST00000487839 1071 ntTSL 510.35□□□□□ -0.753e-29■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PRRC2A-212ENST00000487089 732 ntTSL 28.94□□□□□ -0.983e-29■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.731e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GADD45A-203ENST00000460575 874 ntTSL 224.09■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-220ENST00000576268 1091 ntTSL 319.54■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-214ENST00000574415 1006 ntTSL 518.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-218ENST00000575632 979 ntTSL 218.02■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-207ENST00000572059 880 ntTSL 516.93■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MOB1B-203ENST00000502869 760 ntTSL 316.92■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MOB1B-204ENST00000509041 2056 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 MINDY2-205ENST00000560289 1859 ntTSL 1 (best)26.86■■□□□ 1.898e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-203ENST00000449878 803 ntTSL 525.81■■□□□ 1.728e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 DALRD3-213ENST00000496568 839 ntTSL 225.46■■□□□ 1.678e-8■■■■■ 44.9
UTP3Q9NQZ2 PHC2-212ENST00000493483 760 ntTSL 325.15■■□□□ 1.628e-8■■■■■ 44.9
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4578.5 ms