Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
U3KQK5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
U3KQK5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U3KQK5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U3KQK5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQK5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQK5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQK5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQK5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQK5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQK5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U3KQK5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms