Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAMTA1Q9Y6Y1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms