Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC61Q9Y6R9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC61Q9Y6R9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC61Q9Y6R9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms