Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PARP3Q9Y6F1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PARP3Q9Y6F1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms