Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHLDA3Q9Y5J5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHLDA3Q9Y5J5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms