Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms