Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDGFL3Q9Y3E1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms