Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTP11Q9Y3A2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms