Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP3M1Q9Y2T2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP3M1Q9Y2T2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms