Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD1Q9Y239 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms