Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDZRN3Q9UPQ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms