Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP1Q9UPQ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms