Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MMP17Q9ULZ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP17Q9ULZ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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