Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC7AQ9ULT0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC7AQ9ULT0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms