Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF3Q9ULD4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF3Q9ULD4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms