Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP45Q9UL16 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms