Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF221Q9UK13 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF221Q9UK13 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms