Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCTN4Q9UJW0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DCTN4Q9UJW0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms