Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLCO3A1Q9UIG8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO3A1Q9UIG8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO3A1Q9UIG8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO3A1Q9UIG8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO3A1Q9UIG8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms