Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFMBT1Q9UHJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFMBT1Q9UHJ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms