Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC3Q9UHC3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASIC3Q9UHC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms