Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX1-2Q9UD57 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms