Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM8A1Q9UBU6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM8A1Q9UBU6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms