Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPRR3Q9UBC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPRR3Q9UBC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms