Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL42Q9P2K6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL42Q9P2K6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms