Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC44.26■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC44.21■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.67
CCDC180Q9P1Z9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms