Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC59Q9P031 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC59Q9P031 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms