Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NKIRAS2Q9NYR9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKIRAS2Q9NYR9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms